درمانگاه باران کرمان با یاری چندتن از پزشکان مجرب و با نظارت دانشکده علوم پزشکی استان کرمان، اقدام به ایجاد بخش‌های متعددی در زمینه سلامت کرده است که در این بین می‌توان به دپارتمان‌های ذیل اشاره نمود:

دپارتمان روانشناسی بالینی

دپارتمان قلب و بیماری‌های قلبی کودکان

دپارتمان فوق تخصص مغز و اعصاب کودکان

دپارتمان فوق تخصص شبکیه چشم

دپارتمان مامایی

دپارتمان تخصصی زنان و زایمان

دپارتمان تغذیه و مشاوره غذایی

دپارتمان زخم دیابتی و زخم‌های عروقی

آموزش اصول شیردهی به نوزادان